一、教材及配套实验教材
　　在本课程的开设中，先后编写出版2本教材和1本实验教材。马文漪、杨柳燕编写的《环境工程微生物学》于1998年由南京大学出版社出版，使用至今，仍然受到好评。2002年，杨柳燕、肖琳在原有教材的基础上，扩充了大量近年来在环境微生物学中的进展，编写的《环境微生物技术》由科学出版社出版。2004年，又在南京大学“985工程”一期的资助下，编写并由环境科学出版社出版了《环境微生物学实验技术》作为配套的实验教材。
　　《环境微生物学实验技术》是在总结本院近20年教学实践的基础上编写而成的，内容涵盖全面，经过3年的教学实践，学生普遍反映提高了动手能力，证明取得了较好的教学效果。

　　二、前沿资料
　　为了促进学生的自主学习，推荐学生进行专业学术期刊，如《环境科学》、《Applied and Environmental Microbilogy》等的查阅，使学生在课程的学习中能涉猎更多的相关知识，提升学生的学习兴趣。

　　三、多媒体和实践教学环境
　　本课程已经自2003年起全部实现多媒体电化教学，充分利用多媒体教学的优势，大量补充教科书以外的内容，旨在拓展学生的知识面，启发学生的思维，鼓励学生独立思考和解决问题。
　　目前实验课的教学依托环境科学与工程教学综合实验室，在60平方的本科教学实验室进行，可以保证实验的高质量的开展。

　　四、网络课程建设
　　2007年本课程获得校级精品课程，并拟在此支持下，进行网络课程的建设，拟以教育部的《现代远程教育技术规范》作为网络课件研发的指导思想，并综合自主学习型和讲授型课件的特点，运用现代教育技术，采用多媒体技术、网页设计技术、网络课程设计技术以及根据本课程的特点进行设计和制作。